Родился в 1868 году в Бобруйске Минской губернии в мещанской еврейской семье. Учился на медицинском факультете Киевского университета. После его окончания в 1892 году откликнулся на предложение Симбирского земства принять участие в борьбе с голодом и холерой в нашем крае. Он приезжает в село Мадаево Ардатовского уезда и устраивается врачом в земской больнице.

В 1897 году Шостака избирают делегатом на губернский съезд врачей, где он зачитывает свой первый доклад «О современном состоянии медицины в Ардатовском уезде» – первое обращение Якова Ефремовича к статистике (впоследствии он будет лучшим губернским медицинским статистиком. – Авт.). В 1901 году Шостак перешел в Губернскую земскую больницу. Он занимал должности ординатора заразного, а затем хирургического отделения, заведующего гинеколого-акушерским и заразным отделениями. 1917 год застал его в должности заведующего хирургическим отделением.

С 1903-го по 1913 год он преподавал гигиену в Симбирской чувашской учительской школе. Врачебные таланты Шостака, который лучше других врачей лечил трахому у прибывших в школу чувашских детей, отмечал и педагог И.Я. Яковлев.

Подробнее читайте в материале журнала "Мономах" Симбирские интеллигенты на переломе эпох